Grégoire doit faire équipe avec une pimbêche pour écrire avec elle un nouveau chapitre du Livre des mages. Ce nouvel épisode est peuplé de créatures extraordinaires, dragons, lutins, méduses, etc.
Grégoire est un petit garçon sans histoires. Mais par une nuit sans sommeil, il découvre un médaillon caché dans la chambre de sa nouvelle demeure. L'étrange objet va lui ouvrir les portes d'un monde oublié de tous, où la magie règne encore...
Grégoire doit repartir d'urgence au XVIIe siècle. Il vient de découvrir que la collégiale a été détruite à cette époque et il veut à tout prix prévenir Phidias et ses amis. Après un passage obligé chez son horrible tante, il parvient finalement à repartir dans le passé grâce au talisman caché sous le plancher de sa chambre.
Grégoire repart au XVIIe siècle afin de retrouver la gargouille Phidias et les autres créatures féeriques qui doivent défendre à nouveau la collégiale. C'est ainsi qu'il reprend son apprentissage de la magie et se trouve confronté aux armées du Mage noir.
Quelqu'un dans le passé semble vouloir empêcher Grégoire de créer les gardiens. Il est persuadé qu'il ne peut s'agir que de sa cousine Edna. Parti à sa poursuite, il se retrouve en plein cours de magie, du temps où Phidias était encore un jeune garçon...
Bien que Grégoire ait promis à ses parents qu'il ne partirait plus, le voilà en route pour une nouvelle aventure. Grâce à son talisman, il se rend au XVIIe siècle dans un monde où les gargouilles s'animent pour devenir de vrais dragons et où il doit lutter contre les forces de la magie noire.